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- MNPEF - Mestrado Nacional Profissional em Ensino de Física 3
- POSAGRO - Programa de Pós-Graduação em Agronomia 99
- PPG-BIONORTE - Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal 22
- PPG-DRA - Programa de Pós-Graduação em Desenvolvimento Regional da Amazônia 22
- PPG-EDU - Programa de Pós-Graduação em Educação 3
- PPG-GEO - Programa de Pós-Graduação em Geografia 81
- PPGANTS - Programa de Pós-Graduação em Antropologia Social 15
- PPGCOM - Programa de Pós-Graduação em Comunicação 1
- PPGDRA - Programa de Pós-Graduação em Desenvolvimento Regional da Amazônia 43
- PPGEDUC - Programa de Pós-Graduação em Educação 38
- PPGFIS - Programa de Pós-Graduação em Física 27
- PPGL - Programa de Pós-Graduação em Letras 61
- PPGQ - Programa de Pós-Graduação em Química 33
- PPGSOF - Programa de Pós-Graduação em Sociedade e Fronteiras 96
- PROCISA - Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde 28
- PROFÁGUA - Programa de Mestrado Nacional Profissional em Gestão e Regulação em Recursos Hídricos 32
- PROFMAT - Programa de Mestrado Nacional Profissional em Matemática 20
- PROFNIT - Programa de Pós-Graduação em Propriedade Intelectual e Transferência de Tecnologia para a Inovação 39
- PRONAT - Programa de Pós-Graduação em Recursos Naturais 146